ปุ๋ยอินทรีย์ รวมความว่าปุ๋ยที่ได้จากอินทรีย์สารซึ่งเกิดขึ้นโดยกระบวนการมากมาย ทั้งที่ได้จากมูลของสัตว์ ไม่ก็ซากพืช ซากสัตว์ ฯลฯ พร้อมด้วยยิ่งไปกว่านี้แล้วปุ๋ยอินทรีย์ยังมีผลประโยชน์ต่อพืชเป็นอันมาก แต่กระนั้นทั้งนี้ทั้งนั้นแล้วกว่าจะได้ปุ๋ยอินทรีย์ก็ต้องเวลาและผ่านขบวนการเปลี่ยนแปลงหลายชนิด ทางชีวภาพเสียก่อน
ปุ๋ยอินทรีย์ เป็นวัตถุที่มีสรรพคุณในการซ่อมแซมสภาพหรือประเภทของดินให้พอสมควรต่อการโตขึ้นของพืช ทำให้ดินมีสภาพการระบายน้ำ ระบายอากาศดีขึ้น ทั้งยังช่วยให้ดินมีความสามารถในการอุ้มน้ำ หรือไม่ก็ซึมน้ำที่จะเป็นผลดีต่อพืชไว้ได้งอกงาม ช่วยลดการจับตัวเป็นแผ่นแข็งของพื้น ทำเอาการงอกของเม็ดหรือการซึมของน้ำลงไปในดินง่ายขึ้น ช่วยลดการหลากของน้ำเวลาฝนตก เป็นการลดการพัดพาหน้าดินที่อุดมสมบูรณ์ไป นอกจากนี้แล้วสรรพคุณของปุ๋ยอินทรีย์ก็คือ อยู่ในดินได้นมนานและค่อย ๆ ปล่อยธาตุอาหารออกมาอย่างช้า ๆ จึงมีโอกาสสูญเสียน้อยกว่าปุ๋ยเคมี ทำให้รุ่งเรืองขึ้นให้จุลชีวินในดินเป็นพิเศษ พวกที่มีค่าต่อการบำรุงดินให้ทำงานอย่างมีความสามารถมากยิ่งขึ้น เมื่อใส่ร่วมกับปุ๋ยเคมี จะทำให้ดีขึ้นปุ๋ยเคมีให้เป็นคุณประโยชน์แก่พืชอย่างมีศักยภาพพร้อมมีธาตุอาหารเสริม อยู่เกือบพร้อมตามความต้องการของพืชนั้นเอง